Les maladies inflammatoires de l'intestin (MICI) sont des maladies inflammatoires chroniques du tractus gastro-intestinal qui affectent les jeunes et peuvent gravement affecter leur qualité de vie.
Il est actuellement suggéré que les MICI résultent d'une réponse immunitaire inappropriée envers le microbiote intestinal chez un individu génétiquement prédisposé. Bien qu’étudier les interactions entre le système immunitaire et le microbiote soit d'un grand intérêt pour améliorer nos connaissances sur les MICI, analyser directement leurs interactions dans une cohorte de patients est grevé de nombreux biais.
L'objectif d'ENIGMA est donc de mieux comprendre les interactions entre le système immunitaire, la génétique de l'individu et le microbiote intestinal chez des individus sains.
Plus précisément, nous visons quatre objectifs. Tout d'abord, nous évaluerons deux types de microbiote : celui présent dans les selles et celui adhérent à la muqueuse intestinale. Deuxièmement, à partir de biopsies intestinales, nous évaluerons les interactions entre le système immunitaire muqueux et le microbiote adhérent en utilisant une approche particulière appelée single cell RNA-seq. Troisièmement, nous évaluerons la stabilité de la réponse immunitaire et du microbiote luminal au cours d’un an de suivi. Quatrièmement, sur base de travaux complémentaires que nous menons actuellement, nous chercherons des marqueurs génétiques qui pourraient influencer la réponse immunitaire et le microbiote muqueux et/ou luminal.
L'influence mutuelle entre le système immunitaire et le microbiote est de plus en plus reconnue mais les détails sur cette relation complexe sont encore rares chez l’individu sain. Ainsi, la conception de ce projet ambitieux dans une cohorte saine représente une étape précieuse en vue d'apporter plus de compréhension sur la physiopathologie complexe des MICI.
